Α. Της Ρωμαϊκής και της Α΄ Βυζαντινής περιόδου (64 – 824)
- 1 Τίτος Απόστολος (64 – )
- 2 Φίλιππος (170 – 190)
- 3 Κύριλλος Ιερομάρτυς († 304)
- 4 Μύρων (περ. † 350)
- 5 Ικόνιος (431)
- 6 Μαρτύριος (451)
- 7 Θεόδωρος (553)
- 8 Ιωάννης Α’ (597)
- 9 Παύλος (667)
- 10 Ευμένιος (περ. † 668)
- 11 Ανδρέας Κρήτης (712 – 740)
- 12 Ηλίας Α’ (787)
- 13 Ιωάννης Β’
- 14 Νικήτας Α’
- 15 Νικήτας Β’
Β. Της περιόδου της Αραβοκρατίας (εκτός της νήσου) (824 – 961)
- 16 Βασίλειος Β’ (823 – 828)
- 17 Βασίλειος Γ’ (879)
- 18 Ηλίας Β’ (μεταξύ 920 – 961)
Γ. Της Β΄ Βυζαντινής περιόδου (961 – 1204)
- 19 Ανδρέας Β’ (τέλος 10ου αι.)
- 20 Νικήτας Γ’
- 21 Στέφανος Β’ (1028)
- 22 Ιωάννης Γ’ (1166 – 1172 )
- 23 Λέων
- 24 Μιχαήλ
- 25 Κωνσταντίνος Α’
- 26 Ηλίας Γ’
- 27 Βασίλειος Δ’
- 28 Κωνσταντίνος Β’
- 29 Νικόλαος Α’
- 30 Ιωάννης Δ’
- 31 Μανουήλ Α’
- 32 Μανουήλ Β’
- 33 Νικόλαος Β’
Δ. Της περιόδου της Βενετοκρατίας (εκτός Κρήτης) (1024 – 1645)
- 34 Νικηφόρος Α’ ο Μοσχόπουλος (1285 – 1322)
- 35 Μακάριος (1357)
- 36 Άνθιμος ο Ομολογητής, μητροπολίτης Αθηνών, Πρόεδρος Κρήτης († 1371)
- 37 Ιγνάτιος μητροπολίτης Παλαιών Πατρών και Πρόεδρος Κρήτης (1381)
- 38 Πρόχορος μητροπολίτης Σταυρουπόλεως και Πρόεδρος Κρήτης (1410)
- 39 Βελισάριος επίσκοπος Κορώνης και Πρόεδρος Κρήτης (1499)
Ε. Της περιόδου της Τουρκοκρατίας (1645 – 1898)
- 40 Νεόφυτος Πατελλάρος (1646 – 1679)
- 41 Νικηφόρος Β’ Σκωτάκης (1679 – 1683)
- 42 Καλλίνικος Α’ (1683 – 1685 )
- 43 Αρσένιος Α’ (1687 – 1688)
- 44 Αθανάσιος ο Καλλιπολίτης (1688 – 1697)
- 45 Καλλίνικος Β’ (1697 – 1699)
- 46 Αρσένιος Β’ (1699 – 1701)
- 47 Ιωάσαφ Α’ (1702 – 1710 )
- 48 Κωνστάντιος ο Χαλκιόπουλος (1711 – 1716 και 1719 – 1722)
- 49 Γεράσιμος Α’ ο από Κισσάμου (1716 – 1719)
- 50 Δανιήλ ο από Ριθύμνης (1722 – 1725)
- 51 Γεράσιμος Β’ ο Λετίτζης (1725 – 1755)
- 52 Γεράσιμος Γ’ ο Χίος (1756 – 1769)
- 53 Ζαχαρίας ο Μαριδάκης (1769 – 1786)
- 54 Μάξιμος ο Προγιαννακόπουλος (1786 – 1800)
- 55 Γεράσιμος Δ’ ο Παρδάλης, εθνομάρτυς (1800 – 1821)
- 56 Μεθόδιος ο από Καρπάθου (1823 -)
- 57 Καλλίνικος Γ’ ο εξ` Αγχιάλου (1823 – 1830)
- 58 Μελέτιος Α’ ο Νικολετάκης (1831 – 1839)
- 59 Πορφύριος ο από Μυτιλήνης (1839)
- 60 Καλλίνικος Δ’ Γαργαλάδος (1839 – 1842)
- 61 Καλλίνικος Ε’ ο Χούγιας (1842 – 1843)
- 62 Χρύσανθος ο Λέσβιος (1843 – 1850)
- 63 Σωφρόνιος ο από Αίνου (1850)
- 64 Διονύσιος Α’ ο Βυζάντιος (1850 – 1856)
- 65 Ιωαννίκος ο Ξεφλούδης (1856 – 1858)
- 66 Διονύσιος Β’ ο Χαριτωνίδης (1858 – 1868)
- 67 Μελέτιος Β’ ο Καλύμνιος (1868 – 1874 και 1877 – 1882)
- 68 Σωφρόνιος Β’ ο από Διδυμοτείχου (1874 – 1877)
- 69 Τιμόθεος Α’ Καστρινογιαννάκης (1882 – 1897)
ΣΤ. Της περιόδου της ελευθερίας (1898 – σήμερον)
- 70 Ευμένιος Β’ ο Ξηρουδάκης (1898 – 1920)
- 71 Τίτος Β’ ο Ζωγραφίδης (1922 – 1933)
- 72 Τιμόθεος Β’ ο Βενέρης (1934 – 1941)
- 73 Βασίλειος Ε’ ο Μαρκάκης (1941 – 1950)
- 74 Ευγένιος Α’ ο Ψαλιδάκης (1950 – 1978)
- 75 Τιμόθεος Γ’ ο Παπουτσάκης (1978 -2006)
- 76 Ειρηναίος Α’ ο Αθανασιάδης ( 2006 – 2022 )
- 77 Ευγένιος Β’ ο Αντωνόπουλος (2022 -)
